Станки лазерной сварки, кроме явных преимуществ, по сравнению с традиционными видами сварки, обладают недостатками:

• Более высокая стоимость  станков для лазерной сварки
• Себестоимость процесса лазерной сварки более высокая 
• Квалификация сварщика требуется более высокая
• Лазерная сварка хорошо работает с металлами небольшой толщины и хуже с толстыми металлами
• Низкий КПД лазерных источников. Это приводит к высоким и нерациональным энергозатратам, эффективными из которых являются менее 20%.